Epigenomic Profiling of Circulating Free DNA (cfDNA) to Characterize the Dynamic Evolution of Extensive Stage Small Cell Lung Cancer Molecular Subtypes During First-Line Chemo-Immunotherapy (EPICIRC SCLC).

Les cancers bronchiques à petites cellules (CPC) représentent un sous-groupe de cancers pulmonaires de mauvais pronostic. Au stade étendu, le traitement repose sur la chimiothérapie associée à une immunothérapie par anti-PD-L1. L’étude du profil transcriptionnel d’échantillons tumoraux de CPC a permis de définir quatre sous-types moléculaires aux vulnérabilités thérapeutiques particulières. La stabilité de ces sous-types au cours des traitements anti-cancéreux est encore mal connue en raison de l’absence d’échantillons tumoraux prélevés après le diagnostic initial. Le projet EPICIRC SCLC a pour objectif d’étudier, chez des patients atteints de CPC étendu, l’évolution des 4 sous-types moléculaires durant la première ligne de chimio-immunothérapie, grâce à un profilage épigénomique de l’ADN circulant libre sur des échantillons de plasma prélevés au diagnostic, après 3 mois de traitement, et à la progression tumorale. Des analyses épigénomiques, incluant la méthylation de l’ADN circulant (cf-MeDIP), l’étude de modifications post-traductionnelles des histones H3K27/H3K4 par cf-ChIP-seq, et le séquençage du génome entier à faible profondeur (lpWGS), seront employées afin de définir le sous-type moléculaire de CPC. Ce projet permettra une meilleure compréhension des mécanismes de résistance à la chimio-immunothérapie et fournira une description des cibles thérapeutiques potentielles pour la deuxième ligne de traitement.